Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms