Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5294J3QP53 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Gm5294J3QP53 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm5294J3QP53 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms