Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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