Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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