Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef1G3X9K3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms