Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Crocc2F6XLV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms