Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6619F6URP1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms