Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms