Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms