Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms