Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms