Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms