Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms