Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms