Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprbB2RU80 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprbB2RU80 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprbB2RU80 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprbB2RU80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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PtprbB2RU80 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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