Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms