Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms