Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skp2Q9Z0Z3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Skp2Q9Z0Z3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skp2Q9Z0Z3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skp2Q9Z0Z3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms