Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmod3Q9JHJ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmod3Q9JHJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms