Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Exosc9Q9JHI7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Exosc9Q9JHI7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Exosc9Q9JHI7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Exosc9Q9JHI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Exosc9Q9JHI7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms