Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOX1Q9H6W3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIOX1Q9H6W3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIOX1Q9H6W3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms