Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syvn1Q9DBY1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syvn1Q9DBY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syvn1Q9DBY1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms