Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Subh2bvQ9D9Z7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Subh2bvQ9D9Z7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms