Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hcfc2Q9D968 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcfc2Q9D968 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms