Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms