Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hps4Q99KG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hps4Q99KG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps4Q99KG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms