Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcaf2Q921K8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf2Q921K8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf2Q921K8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms