Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SnrkQ8VDU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SnrkQ8VDU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SnrkQ8VDU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SnrkQ8VDU5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms