Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CrebrfQ8CDG5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CrebrfQ8CDG5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CrebrfQ8CDG5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CrebrfQ8CDG5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms