Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scfd2Q8BTY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scfd2Q8BTY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scfd2Q8BTY8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scfd2Q8BTY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms