Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcfc2Q8BKT3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcfc2Q8BKT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcfc2Q8BKT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms