Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo28Q8BIG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo28Q8BIG4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo28Q8BIG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo28Q8BIG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms