Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2bQ80XK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg2bQ80XK6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms