Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Robo2Q7TPD3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Robo2Q7TPD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Robo2Q7TPD3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Robo2Q7TPD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Robo2Q7TPD3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms