Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc82Q6PG04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc82Q6PG04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc82Q6PG04 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc82Q6PG04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms