Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp140Q6NSQ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sp140Q6NSQ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp140Q6NSQ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp140Q6NSQ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms