Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12bQ6KAU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12bQ6KAU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mvb12bQ6KAU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12bQ6KAU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms