Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qtnf6Q6IR41 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1qtnf6Q6IR41 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf6Q6IR41 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms