Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nckap5lQ6GQX2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nckap5lQ6GQX2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nckap5lQ6GQX2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nckap5lQ6GQX2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms