Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot7Q60809 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnot7Q60809 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnot7Q60809 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms