Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sik1Q60670 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sik1Q60670 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Sik1Q60670 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sik1Q60670 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sik1Q60670 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sik1Q60670 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik1Q60670 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms