Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tdrd5Q5VCS6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms