Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc42Q5SV66 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc42Q5SV66 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms