Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPH3

4930438A08Rik, Amine oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930438A08RikQ5SPH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930438A08RikQ5SPH3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930438A08RikQ5SPH3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930438A08RikQ5SPH3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms