Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhdc9Q3USL1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhdc9Q3USL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhdc9Q3USL1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms