Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3UJP5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3UJP5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3UJP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3UJP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3UJP5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3UJP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3UJP5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UJP5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UJP5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UJP5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UJP5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UJP5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3UJP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms