Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trafd1Q3UDK1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trafd1Q3UDK1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms