Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfaip8l3Q3TBL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms