Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
VgfQ0VGU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VgfQ0VGU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VgfQ0VGU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms