Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gli2Q0VGT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Gli2Q0VGT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gli2Q0VGT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli2Q0VGT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms